Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms