Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHGAP10645 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHGAP10645 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHGAP10645 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms