Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYNX1P0DP58 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms