Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GIMD1P0DJR0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms