Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIL1P09327 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIL1P09327 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIL1P09327 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIL1P09327 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIL1P09327 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIL1P09327 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIL1P09327 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms