Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HLA-AP01891 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HLA-AP01891 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms