Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA3O96018 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA3O96018 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA3O96018 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA3O96018 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA3O96018 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBA3O96018 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBA3O96018 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBA3O96018 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APBA3O96018 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APBA3O96018 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APBA3O96018 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APBA3O96018 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APBA3O96018 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APBA3O96018 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
APBA3O96018 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APBA3O96018 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APBA3O96018 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms