Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms