Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VAMP4O75379 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms