Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRP5O75197 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRP5O75197 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5O75197 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5O75197 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5O75197 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5O75197 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5O75197 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5O75197 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5O75197 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5O75197 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5O75197 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRP5O75197 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRP5O75197 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRP5O75197 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRP5O75197 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRP5O75197 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRP5O75197 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms