Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLXNC1O60486 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXNC1O60486 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms