Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPLO60437 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPLO60437 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPLO60437 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPLO60437 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPLO60437 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPLO60437 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms