Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS1O15524 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOCS1O15524 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms