Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCAO15360 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCAO15360 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCAO15360 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCAO15360 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCAO15360 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCAO15360 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCAO15360 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCAO15360 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCAO15360 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCAO15360 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCAO15360 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCAO15360 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCAO15360 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms