Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DFFAO00273 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DFFAO00273 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DFFAO00273 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DFFAO00273 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DFFAO00273 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DFFAO00273 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
DFFAO00273 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DFFAO00273 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DFFAO00273 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DFFAO00273 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms