Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms