Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVH48-1M5A8F1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms