Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3QQQ9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
J3QQQ9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3QQQ9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms