Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN34H7C241 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN34H7C241 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms