Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4E171 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4E171 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4E171 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4E171 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
B4E171 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
B4E171 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4E171 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4E171 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4E171 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms