Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM200CA6NKL6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms