Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL1A6NKG5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL1A6NKG5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms