Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms