Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms