Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF1Q9Y6D6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms