Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms