Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80Q9ULG1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms