Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYH13Q9UKX3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH13Q9UKX3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms