Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms