Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARGC1AQ9UBK2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms