Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD1BQ9P298 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms