Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms