Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO28Q9NVF7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms