Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB4Q9NTQ9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms