Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms