Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUOX1Q9NRD9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms