Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHST12Q9NRB3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms