Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FZD3Q9NPG1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FZD3Q9NPG1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms