Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-5Q9HDB9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-5Q9HDB9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms