Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPR88Q9GZN0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPR88Q9GZN0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms