Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NLRP1Q9C000 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP1Q9C000 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms