Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms