Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMUB1Q9BVT8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms