Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GINS3Q9BRX5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms