Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MESP1Q9BRJ9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MESP1Q9BRJ9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms