Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FYCO1Q9BQS8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms