Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGIP1Q9BQI5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms