Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCK3Q9BQ16 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms