Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBP4Q96PP9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms