Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMTM3Q96MX0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMTM3Q96MX0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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